庄颜离开罗辑的原因主要有以下几种说法：
形象变化
庄颜在公众面前成为救世主后，她的形象在眼中发生了变化。她意识到与自己朝夕相处的是毁灭了一个世界且掌控另外两个世界命运的陌生男人，这令她和孩子感到害怕，于是她们选择离开。
主动选择
另一种说法是，罗辑主动让她们离开，以便她们能过正常生活。从罗辑所承担的责任来看，留在他身边对庄颜来说不是最好的选择，离开能让罗辑心无旁骛地成为执剑人，庄颜也能过上安静平和的生活。
工作性质
庄颜的离开一方面是工作性质的需要，另一方面她和孩子也是人质。在罗辑成为执剑人后，庄颜和孩子在冥王星与太阳系一起走向终结时，并没有任何情节说明他们曾经和罗辑有过交集，更别说用星环号逃离了。
综合以上几种说法，庄颜离开罗辑的原因可能是多方面的，包括对罗辑形象变化的恐惧、罗辑主动安排她们离开以便他能够专注于责任，以及工作性质的需要。真正的原因可能只有庄颜和罗辑自己清楚。