科学史上著名的科学论战包括：
乌尔班八世与伽利略—不平等的竞争 沃利斯与霍布斯—化圆为方之争
牛顿与莱布尼兹—巨人相搏微积分
伏尔泰与尼达姆—生命形成之谜
达尔文的斗犬和善辩的萨姆—几度风雨进化梦
开尔文出战赫胥黎—地球年龄的冲击
科普和马什—恐龙化石争夺战
魏格纳孤军奋战—大陆漂移说的命运
约翰逊与利基—人猿揖别在何年
弗里曼与米德—探索人类行为的生死战
对热的本性的认识： 历史上“热质说”与“热的运动说”之争光的微粒说与波动说的论争
爱因斯坦与玻尔的历史性论争
伊格纳兹·塞麦尔维斯和查尔斯·德卢森纳·梅格斯：医生洗手争论
查尔斯·达尔文和理查德·欧文：进化论
托马斯·爱迪生与尼古拉·特斯拉：交直流电之战
天体运行的地心说与日心说
波粒大战：光的波动说与微粒说
绝对时空观和相对时空观
生命的起源之争
第一台电子计算机之争
自然发生学说：
从相信老鼠可以通过自然发生的方式产生到雷迪的实验
这些论战不仅推动了科学的发展，也展现了科学家们在学术问题上的坚持和争论。