党组织在纪律审查中发现党员有以下行为时，将根据具体情节给予相应的党纪处分：
贪污贿赂、滥用职权、玩忽职守、权力寻租、利益输送、徇私舞弊、浪费国家资财等违反法律涉嫌犯罪的行为
应当给予撤销党内职务、留党察看或者开除党籍处分。
刑法规定的行为，虽不构成犯罪但须追究党纪责任的行为
包括其他破坏社会主义市场经济秩序、违反治安管理等违法行为，损害党、国家和人民利益的，应当视具体情节给予警告直至开除党籍处分。
违反国家财经纪律的行为
在公共资金收支、税务管理、国有资产管理、政府采购管理、金融管理、财务会计管理等财经活动中有违法行为的，依照上述规定处理。
严重败坏党的形象的行为
例如嫖娼或吸食、注射毒品等，应当给予开除党籍处分。
严重违纪涉嫌违法犯罪的行为
原则上先作出党纪处分决定，并按照规定由监察机关给予政务处分或者由任免机关（单位）给予处分后，再移送有关国家机关依法处理。
综上所述，党组织在纪律审查中会根据党员的具体行为及其严重程度，依法作出相应的党纪处分，并在必要时移送司法机关处理。