公益一类和公益二类事业单位的主要区别体现在以下几个方面：
职责任务和服务对象
公益一类事业单位主要承担义务教育、基础性科研、公共文化、公共卫生及基层的基本医疗服务等基本公益服务。这些服务不能或不宜由市场配置资源，其宗旨、业务范围和服务规范由国家确定。
公益二类事业单位则承担高等教育、非营利医疗等公益服务，这些服务可以部分由市场配置资源。它们按照国家确定的公益目标和相关标准开展活动，在确保公益目标的前提下，可以依据相关法律法规提供与主业相关的服务，收益的使用按国家有关规定执行。
资源配置和财政供给
公益一类事业单位通常获得全额拨款，即财政全额供给，其经费由国家财政予以支撑，不得开展经营活动。
公益二类事业单位则通常获得差额拨款，即财政承担部分，单位承担部分，这种供给方式允许它们在一定程度上通过市场配置资源，并且可以依法开展相关的经营活动，经营性收入主要用于公益事业发展。
收费职能和工资构成
公益一类事业单位没有收费职能，不具备收取费用和从事运营活动的资格。它们的工资构成通常与职能工资相关。
公益二类事业单位则具有全部或部分收费职能，可以收取服务费用。它们的工资构成通常与职称工资相关。
参公情况
公益一类事业单位大多数单位参公，即参照公务员法管理，但并非全部。
公益二类事业单位则全部不参公，如果出现参公情况则属于违规操作。
社会功能和管理模式
公益一类事业单位主要服务于政府机关或公共机构，提供政府决策咨询、公共安全管理、公共资源开发利用等服务，其管理模式较为严格。
公益二类事业单位主要服务于社会公众，提供公共服务、文化教育、健康医疗、社会福利等服务，其管理模式相对独立，具有一定的自主权。
总结：
公益一类事业单位主要承担基本公益服务，不能或不宜由市场配置资源，由国家全额拨款，不得开展经营活动。公益二类事业单位则承担部分可以由市场配置资源的公益服务，可以依法开展相关经营活动，财政供给方式为差额拨款。两者在职能、资源配置、收费职能、参公情况及社会功能等方面存在明显差异。