高树勋起义部下的下场主要取决于他们个人的选择和行动。以下是一些具体的情况和结果：
选择跟随高树勋起义的将领
张弥川：新八军副军长，在起义后选择带着少量亲信仓皇而逃，最终回到汉口，被蒋介石政府冷处理，没有受到惩罚，但也不再受到重用。
马润昌：新8军副军长，起义后偷偷跑回国统区，最终被俘于淮海战场，送入战犯管理所，1961年释放后再无消息。
选择反对或逃离高树勋起义的将领
石友三：被高树勋亲手活埋在黄河岸边，最终被俘并受到惩罚。
高树勋的警卫们：在起义后，高树勋的住所被解放军保卫科包围，形成对峙局面，但最终高树勋主动走向前去询问情况，避免了冲突。
其他未明确记载的将领
部分人因个人利益或对国民党的忠诚，试图阻挠起义的进行，但在高树勋的坚定意志和有效指挥下，这些反对声音最终未能成气候。他们的命运可能在起义的那一刻就已经注定。
总的来说，高树勋起义部下的下场各异，有些人选择跟随起义并得到了新的机会，有些人则因为反对或逃离而受到了不同的处理。