生物多样性的三个层次包括：
物种多样性：
指地球上动物、植物、微生物等生物种类的丰富程度。这是生物多样性最直观的体现，也是生物多样性概念的中心。
遗传多样性 （或称基因多样性）：指地球上生物所携带的各种遗传信息的总和，包括种内和种间的遗传变异。遗传多样性是生物多样性的内在形式，一个物种就是一个独特的基因库，每一个物种都是基因多样性的载体。
生态系统多样性：
指生物与其周围环境所构成的自然综合体，包括不同生态系统之间和生态系统内部的多样性。生态系统多样性是生物多样性的外在形式，保护生物多样性的有效形式之一是保护生态系统的多样性。
这三个层次共同构成了生物多样性的丰富内涵，反映了地球上生命形式的多样性、遗传信息的丰富性和生态系统的复杂性。保护生物多样性对于维持生态系统的健康和人类社会的可持续发展具有重要意义。