根腐病是一种由多种病原体引起的土传病害，包括真菌、细菌等。防治根腐病可以采取综合措施，包括抗病育种、加强田间管理、土壤消毒和使用杀菌剂等。以下是一些常用的防治根腐病的药物：
噁霉灵：
这是一种高效的真菌性杀菌剂，通过抑制真菌正常的生长发育过程来达到杀菌效果，内吸杀菌活性强，可以快速被作物吸收，并在体内运输传导，消灭体内病菌，对根腐病效果好。
咯菌腈：
这是一种防止死根烂苗比较高效的杀菌剂，对真菌性病害如根腐病、菌核病等十分有效。在作物的苗期，使用25g/升的咯菌腈悬浮剂750-1000倍液喷雾幼苗，能预防根腐病、立枯病等病害。
四霉素：
这是一种光谱性的生物杀菌剂，杀菌谱广，可以用于果树、蔬菜、药材等各类农作物，对根腐病有很好效果。
十三吗啉：
属于吗啉类杀菌剂，对根腐病有不错的效果，目前市面上一般登记在根腐病领域。
多菌灵：
这是一种广谱性杀菌剂，对于因真菌而引起的病害有很好防治效果，常用于防治根腐病。每平方米土地使用1.5克50%多菌灵，翻入土壤中即可，或兑水喷施根部。
代森铵：
这是代森类杀菌剂之一，具有较强的杀菌作用，可用于防治大田作物霜霉病、白粉病、叶斑病、根腐病等病害。防治根腐病时，可用300-400倍液45%代森铵，加生根粉进行灌根。
嘧菌酯：
这是一种高效、广谱、新型杀菌剂，对几乎所有真菌纲病害都有良好的防治效果，被誉为“万能杀菌剂”。根腐病发病初期可用25%嘧菌酯悬浮剂1000-2000倍液灌根，每株浇灌药液150-300毫升。
甲霜恶霉灵：
这是一种防治根腐病的有效药剂，可以用于浸种和灌根，对真菌性根腐病有显著效果。
铜制剂：
如噁霜嘧铜菌酯等，也可以用于灌根，防治根腐病。
生物防治剂：
如哈茨木霉菌根部型，可以用于苗床时期和定植后的灌根，增强植物的抗病性。
细菌性杀菌剂：
对于由细菌引起的根腐病，可以使用威百亩、棉隆、五氯硝基苯等化学成分进行土壤消毒。
在选择杀菌剂时，应根据具体的病害类型、作物种类和当地的病原体情况来选择合适的药物。同时，注意按照推荐的浓度和使用方法进行施用，以确保防治效果。