《馒头日记》的结局是温暖而感人的。故事中的主角馒头是一个没有父母的孤儿，他通过卖废品和帮助别人来维持生活，并渴望得到家庭的温暖。在故事中，馒头遇到了他的第一个朋友花卷，一只忠诚的小狗。尽管花卷在故事后期因意外去世，给馒头带来了巨大的悲伤，但最终馒头在经历了种种困难之后，被一对夫妇领养，找到了属于自己的幸福。
故事的结尾，虽然花卷离开了馒头，但作者通过描绘花卷变成天使陪伴在馒头身边，以及其他人对馒头的关爱，传达了一个积极向上的信息，即即使在失去亲近的朋友之后，生活中依然有希望和温暖存在。