互联网药品信息服务资格证书的申请流程通常包括以下几个步骤：
申请
申请人需要登录国家食品药品监督管理总局行政事项受理服务页，进行网上填报公司基本信息。
根据各省市食品药品监督管理部门网上公布的申请服务指南或直接咨询相关部门，准备申请材料。
提交材料
申请人根据各省市食品药品监督管理部门的要求，可以选择网上申报或窗口提交申请材料。
受理和审查
主管部门在收到申请材料后，通常会在5个工作日内进行形式审查，并作出是否受理的决定。
受理后，主管部门会对申报单位和材料进行审查，审查通过后，对符合规定的单位准予许可并颁发证件。
发放证书
审查通过后，申请人通常会在1个工作日内收到通知，并可以领取《互联网药品信息服务资格证书》。
请注意，具体的申请流程和要求可能会根据最新的法律法规和政策有所变化，建议在准备申请前向相关部门咨询最新的具体要求和流程。