合法辞退员工的程序主要包括以下几个关键步骤：
明确解除理由
根据《劳动合同法》的相关规定，明确解除劳动合同的理由，如员工严重违反规章制度、不能胜任工作、严重失职等。
收集相应的证据来支持其决定，例如《规章制度签收确认函》、《员工处罚通知书》和《培训记录表》等。
通知工会
如果企业设有工会，应在作出开除决定前，将理由通知工会。
工会有权提出意见或建议，企业应当认真考虑工会的意见。
书面通知员工
在确定解除理由并征得工会同意（如有）后，企业应向员工发出单方解除劳动合同的书面通知书。
这份通知书是企业开除员工的关键法律文件，其内容必须准确、完整、合法。
经济补偿金的计算
根据《劳动合同法》的规定，计算经济补偿金的基数为劳动合同解除之日前十二个月正常总收入的平均数。
如果劳动者月工资高于用人单位所在地区上年度职工月平均工资的三倍，经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付。
办理工作交接
用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。
其他注意事项
如果员工在试用期间被证明不符合录用条件，企业需要建立一套试用期的绩效评估制度，明确考核标准、考核方式及考核方法，并且用人单位制定的考核内容、评分原则及决定劳动者是否最终被录用的客观依据，应事先告知劳动者并让其签字认同。
用人单位在试用期解除劳动合同的，应当向劳动者说明理由，并在试用期届满之前进行考核并作出解除通知。
通过以上步骤，企业可以确保合法辞退员工，并遵守相关的法律规定。建议企业在实施辞退程序时，尽量与员工进行充分沟通，并在必要时寻求法律专业人士的帮助，以确保程序的合法性和有效性。