处理阿里云上的可疑程序可以采取以下步骤：
更新杀毒软件和防病毒软件
确保您的杀毒软件和防病毒软件已更新到最新版本。如果没有更新，请尝试使用更新软件的最新版本。
重新启动计算机
重新启动计算机，如果计算机能够正常启动，则说明病毒已被清除，文件已被删除或修复。
进入安全模式
在安全模式下，尝试进入被更改的文件所在的目录，以查找被更改的文件和被删除的文件。
卸载被更改的文件
如果没有可疑程序或病毒，请将文件恢复为原来的文件名。如果可以恢复，请尝试将其重新命名或备份到安全的地方。
使用系统工具查找和删除可疑进程
通过 `top` 命令查找占用 CPU 和内存高的可疑程序。通过进程号找到程序所在目录，删除相关文件，并停用可疑程序。
安装和配置防病毒软件
安装防病毒软件，如 ClamAV，并进行全盘扫描。确保系统和软件更新至最新版本，安装最新的更新程序，以防止病毒再次感染。
限制远程访问权限
如果可能的话，限制远程访问权限可以减少恶意程序攻击的可能性。在阿里云服务器上，可以设置只允许特定的 IP 地址或者用户进行远程访问。
使用强密码
使用强密码可以防止恶意程序通过暴力破解的方式入侵服务器。在阿里云服务器上，可以设置复杂的密码，避免密码被猜测或暴力破解。
定期备份数据
定期备份数据可以防止恶意程序对数据造成破坏。在阿里云服务器上，可以设置定期备份数据的计划，确保数据的安全。
清除所有可疑的活动
清除所有可疑的活动程序，以防止病毒再次感染计算机。重新启动计算机以确保它已经清除病毒和其他可疑活动。
联系阿里云客服
如果您仍然无法解决问题，请联系阿里云客服寻求进一步的帮助和支持。
这些步骤可以帮助您有效地处理阿里云上的可疑程序，确保服务器的安全。