运管程序违法主要涉及以下几个方面：
调查取证程序违法
目的和意义：调查取证是为了获取证据，以确定违法行为的性质和情节。
违法情形：如果调查取证过程中存在程序上的违法，如未依照法定程序进行、证据收集不合法等，则属于程序违法。
处罚依据违法
法律依据：运管部门的罚款依据《中华人民共和国道路交通安全法》和《中华人民共和国道路运输条例》等相关法律法规。
违法情形：如果处罚依据本身存在违法，如引用已经废止或错误的法律法规条款，则属于依据违法。
处罚程序违法
处罚决定程序：在作出处罚决定时，必须遵循法定程序，包括听取当事人的陈述和申辩、告知处罚依据和权利等。
违法情形：如果在处罚决定过程中未依法履行这些程序，如未听取当事人的陈述和申辩，或未告知当事人处罚依据和权利，则属于程序违法。
其他相关程序违法
行政强制措施：在执法过程中，如需采取行政强制措施，必须遵循法定程序，如未依法出示证件、未告知当事人权利等。
执法过程记录：执法过程应有完整记录，包括执法时间、地点、人员、措施等，未依法记录或记录不完整也属于程序违法。
建议
加强法律培训：运管部门应加强对执法人员的法律培训，确保其熟悉相关法律法规和执法程序。
完善执法流程：运管部门应完善执法流程，确保每一步骤都符合法律规定，避免程序违法。
强化监督机制：建立健全内部监督和社会监督机制，对运管部门的执法行为进行有效监督，及时发现和纠正程序违法问题。
通过以上措施，可以有效减少运管程序违法的发生，保障道路运输市场的合法有序运行。