替换压缩包中的程序通常涉及以下步骤：
解压原始压缩包
将需要替换的程序压缩包（如 `.jar` 或 `.zip`）解压到一个临时目录中。
定位并替换文件
在解压后的目录中找到需要替换的文件，并将其替换为新的文件。
重新压缩
将替换后的文件重新压缩成原始的压缩包格式。
对于 `.jar` 文件：
解压
```sh
jar xvf example.jar
```
编辑
使用 IDE（如 IntelliJ IDEA）或文本编辑器打开解压后的 `.class` 文件，进行编辑。
替换
将编辑后的 `.class` 文件放回解压后的目录中。
重新压缩
```sh
jar uvf example.jar *
```
对于 `.zip` 文件：
解压
```sh
jar xvf example.zip
```
定位并替换文件
使用 `jar tf example.zip` 命令查看文件列表，找到需要替换的文件路径。
将新文件解压到解压后的目录中，并替换原有文件。
重新压缩
```sh
jar uvf example.zip *
```
使用 Java 代码替换 `.jar` 文件中的文件：
```java
import java.io.*；
import java.util.zip.*；
public class ZipFileReplace {
public static void replaceFileInZip（String zipFilePath, String fileToReplace, InputStream newFileContent） throws IOException {
File tempFile = File.createTempFile（"tempZip", ".zip"）；
tempFile.deleteOnExit（）；
try （ZipOutputStream zos = new ZipOutputStream（new FileOutputStream（tempFile））） {
ZipInputStream zis = new ZipInputStream（new FileInputStream（zipFilePath））；
ZipEntry ze = zis.getNextEntry（）；
while （ze != null） {
String fileName = ze.getName（）；
if （fileName.equals（fileToReplace）） {
zos.putNextEntry（new ZipEntry（fileName））；
newFileContent.transferTo（zos）；
} else {
zos.putNextEntry（new ZipEntry（fileName））；
byte[] buffer = new byte；
int len；
while （（len = zis.read（buffer）） > 0） {
zos.write（buffer, 0, len）；
}
}
zos.closeEntry（）；
ze = zis.getNextEntry（）；
}
zis.close（）；
}
// 用新的压缩包替代原有压缩包
Files.move（tempFile.toPath（）, new File（zipFilePath）.toPath（））；
}
public static void main（String[] args） {
try {
// 示例：替换 example.jar 中的 CompanyBindQueryFilter.class 文件
replaceFileInZip（"example.jar", "BOOT-INF/classes/com/ywhz/system/chargeitem/companybind/dao/filter/CompanyBindQueryFilter.class", new FileInputStream（"path/to/new/CompanyBindQueryFilter.class"））；
} catch （IOException e） {
e.printStackTrace（）；
}
}
}
```
注意事项：
备份：在替换文件之前，建议先备份原始压缩包，以防替换过程中出现问题。
兼容性：确保替换后的文件格式和路径与原始文件一致，否则可能导致程序无法正常运行。
权限：确保有足够的权限读取和写入相关文件。
通过以上步骤和注意事项，你可以有效地替换压缩包中的程序。