祖祠翻建程序可以大致分为以下几个步骤：
确定重建目标和规模
明确重建宗祠的目标和规模，包括预计的建筑面积、工程内容（如土建、装修等）以及外围工程（如绿化、道路建设）。
考虑周边环境，确保宗祠建设与之相兼容，避免对周围环境造成不良影响。
制定详细的建筑方案
建筑师根据目标和规模制定建筑方案，包括设计图纸，确保重建宗祠的原始风貌。
与政府相关机构进行沟通并获得必要的许可。
确定和管理工程成本
估算工程成本，包括建筑师、材料、劳务、设备和保险等费用，并制定预算。
在施工过程中严格管控成本，及时发现和处理问题。
环境和文化遗产评估
对祠堂周围的环境进行评估，包括自然环境、人文环境以及祠堂本身的状况。
评估重建风格的选择，力求保留原有文化遗产的历史价值。
翻新修缮
在尽量保留原始材料、结构和装修风格的前提下进行翻新修缮。
预算包括工人人工费用、材料采购费用、设备和设施更新费用等。
施工与监督
按照施工图纸进行施工，确保工程质量。
定期进行进度和质量检查，确保工程按计划进行。
竣工与验收
完成所有工程后，进行整体验收，确保宗祠符合设计要求和建筑规范。
举行竣工典礼，邀请相关宗亲参加，并进行祭祀活动。
后期维护
制定长期的维护计划，确保宗祠的持续完好和传承。
以上步骤仅供参考，具体实施过程中可能需要根据当地政策和实际情况进行调整。建议在实施过程中咨询专业人士，确保每一步骤的合理性和合法性。