农用车注销程序如下：
准备材料
机动车所有人的身份证原件及复印件。
机动车行驶证。
机动车登记证书。
机动车号牌。
《报废机动车回收证明》副本。
如果车辆属于需要监销的校车、大型载客汽车、中型以上载货汽车及其他营运车辆，还需提交汽车查验记录表。
提交申请
将上述材料提交至当地车辆管理所或指定的机动车回收企业。
填写《机动车注册、转移、注销登记/转入申请表》。
车辆检验与拆解
如果车辆需要检验，需前往指定机构进行检验并记录。
机动车回收企业在机动车解体后7日内，将相关申请表、登记证书、号牌、行驶证和《报废机动车回收证明》副本提交至报废地车辆管理所。
审核与注销
报废地车辆管理所应当自受理之日起一日内，审查提交的证明、凭证，收回机动车登记证书、号牌、行驶证，并通过计算机登记系统将机动车报废信息传递给登记地车辆管理所。
登记地车辆管理所应当自接到机动车报废信息之日起一日内办理注销登记，并出具注销证明。
领取注销证明
车管所审核通过后，会出具《机动车注销证明书》给车主。
交付号牌
在完成注销手续后，车主需要将车辆号牌交付给当地车辆管理所，以完成机动车的注销手续。
缴纳税费
在销户车辆之前，车主需要缴纳车辆管理费和车船税等相关费用。
建议：
尽量提前了解当地车管所的具体流程和所需材料，以确保注销过程顺利。
如果车辆存在特殊情况（如灭失），需提供相应的证明材料。
报废车辆时，选择有资质的机动车回收企业，确保流程合法合规。