当程序违法导致无法补办时，可以采取以下措施：
查明事实并进行处理或处罚
首先需要查明违法事实，然后依据相关法律法规进行处理和处罚。处理或处罚决定作出后，应进行相应的处置，并补办相关手续。
撤销行政许可并重新作出
对于程序违法的行政许可，可以向上一级行政机关申请撤销行政许可，并由有权机关重新作出行政许可决定。
申请行政复议
行政相对人如果认为行政行为程序违法，可以在知道行政行为后的60天内申请行政复议。行政复议机关在审查过程中，如果发现程序违法，应当撤销或变更行政行为。
申请行政裁决
在协商未能达成协议的情况下，可以申请行政裁决。如果不履行安置补偿协议或者安置补偿裁决，可以由人民法院强制执行。
法律途径追究责任
对于违反法定程序作出行政许可决定的行政机关或其上级行政机关，可以依法追究其法律责任，包括对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予行政处分。
建议：
尽早咨询专业律师或相关部门，了解具体的法律程序和补救措施，以便及时采取合法有效的行动。
保留所有相关证据，以便在行政复议或法律诉讼过程中使用。
以上措施可以帮助你应对程序违法无法补办的情况，并尽可能减少法律风险。