在京东购买手机时，选择哪个自营店更好，主要取决于消费者的个人需求和偏好。以下是京东自营店和旗舰店的对比分析：
商品质量与售后服务
自营店：京东自营店由京东直接运营和管理，商品质量有保障，通常提供正品保证和较为完善的售后服务，包括退换货和维修。
旗舰店：旗舰店是品牌官方授权的店铺，商品质量和真实性有一定的保证，通常提供品牌官方的售后服务，消费者可以直接与品牌或厂商沟通。
价格与促销
自营店：由于采购渠道广泛，自营店通常能够提供更多的促销活动和优惠价格，尤其是在大型促销活动期间，折扣力度较大。
旗舰店：价格相对较为稳定，较少出现极低折扣的情况，但也会提供一定的购买保障和品质保证。
产品种类与选择
自营店：自营店通常主打热门、主流商品，库存较为充足，能够满足大部分用户的购买需求。
旗舰店：旗舰店通常提供品牌手机的全线产品，对于某些特定品牌的手机型号可能会更有优势，能提供更全面和专业的售前咨询和售后服务。
物流与服务
自营店：京东拥有自己的物流体系，可以确保商品从仓库到消费者手中的速度更快、更安全。
旗舰店：物流由品牌或第三方商家负责，但京东平台也提供一定的支持和服务。
建议
如果消费者更看重商品质量和售后服务，以及更快的物流速度，那么自营店可能是更好的选择。例如，对于购买大品牌和知名厂商的手机，自营店通常更值得信赖。
如果消费者更追求品牌、时尚和潮流，或者想要更多的促销优惠，那么旗舰店可能更适合。例如，对于某些特定品牌的忠实粉丝或需要专业售前咨询和售后服务的用户，旗舰店可能更合适。
综合考虑以上因素，消费者可以根据自己的需求和偏好，在京东自营店和旗舰店之间做出选择。